Т. В. Ширина, А. В. Геращенко, М. Т. Бобровская, В. И. Кашуба

Институт молекулярной биологии и генетики НАН Украины, Киев;
e-mail: t.v.shirina@inbox.ru

Биоинформативными методами показано, что в участках генома вируса ядерного полиэдроза Bombyx mori закодированы две малые РНК – snc RNA-1 и snc RNA-2, которые могут выполнять структурную функцию при  формировании кристаллов полиэдров. Целью работы является установление нуклеотидной последовательности малых некодирующих РНК, предсказанных биоинформативными методами, из полиэдров B. mori. В работе использованы полимеразная цепная реакция (ПЦР), электрофорез в агарозном геле, клонирование продуктов ПЦР, секвенирование.  Установлено, что нуклеотидные последовательности snc RNA-1 и snc RNA-2 комплементарны участкам мРНК полиэдрина, которые включаются в полиэдры B. mori. Эти РНК имеют 100% ю идентичность с последовательностями, предсказанными нами биоинформативными методами. Полученные результаты подтверждают предложенный нами ранее биоинформативный подход по поиску малых РНК, закодированных в геноме B. mori.