А. Ю. Галкин

Национальный технический университет Украины
«Киевский политехнический институт»;
e-mail: alexfbt@mail.ru

Проведен сравнительный анализ экспериментальных методов изучения антигенной структуры протеинов. Подавляющее большинство известных методов основано на иммунохимическом изучении взаимодействия молекул протеинов или пептидов со специфичными антителами. В наиболее эффективных и широко применяемых методах используют  синтетические и генно-инженерные пептиды. За последние 30 лет эти методы прошли заметный эволюцио­нный путь, дойдя до максимальной автоматизации и выявления антигенных детерминант различного типа (линейные, конформационные эпитопы и мимотопы). Большинство алгоритмов по поиску эпитопов интегрировано в компьютерные программы, что значительно облегчает анализ больших массивов экспериментальных данных и позволяет формировать пространственные модели. Для решения прикладных задач можно использовать менее трудоемкий метод сравнительного эпитопного картирования, основанный на анализе профилей конкуренции различных антител при их взаимодействии с антигеном. К физическим методам исследования антигенной структуры протеинов относится рентгеноструктурный анализ комплексов антиген–антитело, который можно применять лишь для кристаллизирующихся протеинов, и ядерный магнитный резонанс.

Ключевые слова: антигенная детерминанта, сайт-направленный мутагенез, синтетические пептиды, фаговый дисплей, эпитопное картирование